La principale tâche confiée aux Assistants académiques à Natolin est de contribuer à la mise en œuvre du programme académique dans le cadre du travail effectué de concert avec le Vice-recteur, le Directeur d’études, le corps enseignant ainsi que l'administration académique.

Tout au long de l'année universitaire les Assistants académiques fournissent des conseils pédagogiques, assurent des travaux dirigés pour certains cours, facilitent le choix du directeur du mémoire de fin d’études tout en aidant dans l’orientation générale du travail de recherche, et de manière globale en apportant tout type de soutien dans le cadre du parcours académique des étudiants à Natolin.

En ce sens, les Assistants académiques sont aussi le lien entre les étudiants et le corps des Professeurs associés au Collège d’Europe. En lien avec ces derniers et la bibliothèque de Natolin ils mettent tout en œuvre pour rendre les supports de cours disponibles pour les étudiants. En coopération avec l’administration académique ils participent au processus administratif ayant trait à l’organisation et au déroulement des sessions d’examens. Tant la coordination de voyages d’études que des conférences relève également de leurs tâches professionnelles. En outre, les Assistants académiques sont impliqués dans le processus de recrutement de futurs étudiants à travers à la fois la pré-sélection sur dossier et la participation aux entretiens. Enfin, les Assistants académiques conduisent leurs propres travaux de recherche.